Résumés des épisodes 1 à 24 de la saison 5.
Episode 1 - Des années volées
Bryan Parker, douze ans, s'enfuit en pleine nuit de chez lui où il vit avec son père, Randall Parker. Il est arrêté par un policier à qui il raconte que son père a enlevé un garçonnet de cinq ans prénommé Todd. Le FBI est aussitôt alerté.
Episode 2 - Strip-tease
Elena Delgado part en couverture comme danseuse dans une boîte de strip-tease dans laquelle travaillait Cindy Peterson, disparue depuis peu. Danny Taylor, lui, se fait passer pour un client intéressé par Elena. Cindy a choisi ce travail pour combler rapidement les dettes de sa famille et le club est le lien commun entre elle et le meurtre récent d'une danseuse.
Episode 3 - Appels d'urgences
Jack et son équipe sont à la recherche d'une opératrice du service d'urgences, Jessica Lawson. L'enquête révèle bientôt que Jessica, que l'on avait menacée de tuer, avait été abordée par un homme dont la femme était morte alors qu'il tentait de joindre Jessica sur la ligne du service d'urgences.
Episode 4 - Tous pour un
Cela fait un peu plus de quatre heures, qu'une adolescente, Malia, a disparu du centre de détention.
Episode 5 - Le mauvais exemple
Cela fait onze heures que Julia Martic, vingt-sept ans, et son fils Petros Marku, huit ans, ont disparu. Un voisin, Paul Bank, dit avoir entendu des cris la veille au soir vers dix heures. Peu après, il est sorti dans son jardin et a vu un homme qui portait un gros sac dans un 4x4 dont il a relevé les deux premières lettres. Cela fait six mois que l'inspecteur et son équipe enquêtent sur le mafioso Sadik Marku. Jack reprend l'affaire car les disparus ne sont autres que le fils et la maîtresse de Sadik.
Episode 6 - Après la tempête
L'équipe recherche Aaron Gibbs, un homme traumatisé et ruiné par le passage de l'ouragan Katrina sur sa propriété. Sherise, son épouse, raconte aux enquêteurs qu'elle a vu Aaron pour la dernière fois, la veille, lorsqu'il a quitté leur chambre de motel. Aaron prétendait avoir retrouvé un job temporaire dans le New Jersey après son éviction de l'entreprise de construction de son cousin. Mais les enquêteurs apprennent qu'Aaron a menti sur toute la ligne et commencent à envisager tous les scénarios possibles
Episode 7 - Exorcisme
Une jeune femme, Katie Duncan, disparaît peu après avoir subi un exorcisme. Martin et l'équipe découvrent rapidement que le prêtre, également disparu, a été suspecté de meurtre un an auparavant après le décès d'un homme exorcisé par ses soins. Ils apprennent aussi que Katie avait entrepris cet exorcisme car la maladie mentale qui la rongeait lui donnait l'impression d'être possédée.
Episode 8 - Main perdante
Après avoir appris la disparition d'Alex Stark, l'équipe de Jack Malone s'interroge sur la vie luxueuse de cet homme. Les agents découvrent qu'il était impliqué dans une affaire douteuse : un club de poker illégal.
Episode 9 - Le protecteur
L'équipe de Jack enquête sur la disparition d'un travailleur social, Eric Hayes, après qu'il a retiré une fille de sept ans du domicile de ses parents. Son père était violent et sa mère dépressive.
Episode 10 - L'espoir
L'équipe recherche Audrey West, une jeune mère de famille à qui il ne reste plus qu'un mois à vivre. Elle a été vue pour la dernière fois lorsqu'elle quittait une réunion pour personnes atteintes du cancer, avec Bryan, un homme qui a brutalement volé l'ordonnance de plusieurs malades. Tandis que les enquêteurs recherchent Bryan, ils découvrent qu'il était le petit ami de l'infirmière d'Audrey. Ils veulent également interroger le patron d'Audrey qui avait accusé la jeune femme de vol de documents.
Episode 11 - Partir
L'équipe de Jack part à la recherche de Ted Soros, jeune basketteur de 17 ans. Cet enfant d'ouvriers immigrés s'était fait émanciper pour pouvoir rejoindre un lycée réputé, très prisé des recruteurs. Il a disparu le soir d'un match de championnat où son jeu remarquable avait assuré à son équipe la victoire. Pendant ce temps, Anne annonce de tristes nouvelles à Jack.